怒族的宗教信仰，主要是本民族的原始宗教，其发展可分为自然崇拜、图腾崇拜和祖先崇拜三个阶段。
自然崇拜是指怒族所信仰的原始宗教尚处于较低级的万物有灵阶段。在他们看来，自然界中的日月、星辰、山川、河流、巨树、怪石等一切现象和事物都有神灵存在，并支配着人们社会生活的各个方面。如，水火崇拜主要表现在捕鱼捞虾的祭奠活动和天旱水涸时的祈雨仪式，以及对灶神的祭奠和对火塘的禁忌当中。而山石崇拜则集中表现在对崖神的崇拜与祭奠活动当中。
在怒族原始宗教里，崖神经常同山神、猎神以及雨神、谷神等神祗混为一体而难以区分。如在怒苏人中，崖神“米处于”仅仅是司某种疾病的鬼神之一；但在阿龙人中，崖神“吉米达”，是集山神、猎神、谷神、生育神、婚配神和保护神于一身的重要神祗。它主宰着山林的繁茂衰落和野兽的出没，主宰着谷物的生长，也主宰着人间的疾病、婚姻和生育，甚至还主宰着自然界的阴晴雨雾和月缺月圆。几乎较大的溶洞和崖壁都有崖神的传说。传说中的崖神几乎都是人变的，有男有女而以女性居多。这一点在怒族男子出猎之前和出猎归来之后对女猎神顶礼膜拜的祭奠活动和有关女猎神的诸多传说当中尤为突出。这些传说中的各种崖神同凡人一样，有配偶家庭，有七情六欲。他们之间有悲欢离合，也有相互仇杀，更有善恶之分。善良的崖神能庇护人畜平安，带来好运；邪恶的崖神或给人降灾致病，或掳人妻女。有关这方面的神话传说，在怒族民间文学中占有重要的地位。正因为如此，人们对善良的崖神虔诚朝拜，供以大量祭品；对作恶的崖神异常惧怕、敬而远之，或采取顺势巫术，满足其欲求，限制其恶行。而无论是祭拜还是巫术，都布满了原始的生殖崇拜和性器官崇拜遗迹（何叔涛：《贡山怒族的崖神崇拜》，《怒江文史资料选辑》第14辑）在此过程中，人们把酷似人体的溶岩和山峰，视作崖神的化身加以膜拜。
总之，怒族原始宗教中对崖神的祭拜，已逐步取代了对其他鬼神的祭拜。而“朝山节”祭拜崖神，成了最主要的宗教礼仪。
怒苏人是怒族中保留图腾崇拜遗迹最多的一个支系，而图腾实际上是人们把与自己生活关系较为密切的某种动植物当作自己祖先来加以崇拜的一种原始信仰。伴随着图腾崇拜的是各氏族关于图腾物是自己祖先的传说，对图腾物的禁忌，以及把图腾物作为本氏族的名称和标志。世界上绝大多数民族都曾有过图腾崇拜，而怒族则是我国少数民族原始宗教信仰中保留图腾崇拜遗迹较多的民族之一。
在图腾传说中，最有代表性的是怒苏支系中关于蜂氏族的传说和蛇氏族的传说。
蜂氏族传说：远古时代，天降群蜂，落在怒江边腊甲底村，蜂蛇婚配，生下怒族女始祖茂英冲(一说茂英冲是从蜂筒中出来)，茂英冲长大后又分别与虎、鹿、麂子、熊、鼠、鸟婚配，其后代分别繁衍为怒苏各氏族。
蛇氏族传说：古代一位织布的少女，歌声打动了一条巨蛇，巨蛇变成小青虫来听歌，并向少女求婚，少女答应它如能变成人就和它成亲，结果小青虫果然变成一英俊少年，二人结为夫妻后，所生子女即发展为蛇氏族。
从某种意义上讲，图腾崇拜只不过是自然崇拜的深化。
怒族的祖先崇拜主要表现在一些创世神话中，讲述着人类起源，如闻名的《创世歌》(又叫《瘟神歌》，因祭奠瘟神所唱而得名)。主要讲述远古时代洪水泛滥，人类仅剩兄妹二人，因得到天神或动物(九江狸)的启示，躲进葫芦或竹筐、蜂窝、树洞等藏身，得以保全性命；最后兄妹二人出于无奈而遵照天意结为夫妇，生下的后代就是人类各民族或怒族各氏族的祖先。其中《创世诗》中还有类似汉民族“后羿射日”的传说，不同的是，传说中的怒族勇士射落了九个太阳中的八个、七个月亮中的六个，而不是十个太阳中的九个。
但在家中，怒族还没有崇拜祖先的习尚，屋里一般不供奉祖先的灵牌，安葬后除第一年垒坟上坟外，以后均不再扫墓。
近代以后，基督教、天主教传入怒族地区，对怒族产生了一定的影响。在与藏族相邻的贡山北部，也有一些怒族群众信喇嘛教，但人数较少。
1950年后，由于实行了宪法规定的宗教信仰自由政策，无论是信仰藏传佛教还是信仰天主教或基督教的怒族教徒，其宗教信仰和宗教感情均得到尊重，正常的宗教活动亦受到法律的保护。
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